Sí, efectivamente, hay un matiz importante entre ambos términos "eliminar" y "desechar". En "eliminar hay una connotación radical, al igual que "destruir". "Desechar" tiene un significado que se vincula más con la utilidad. Descarto o desecho la posibilidad de hacer algo. No quiero que desaparezca, no quiero eliminarlo. Algo que descarto hoy, quizá lo haga o utilice mañana. En fin, descartar es menos radical.